生物安全柜中，HEPA過濾網有足夠的纖維使得10,000個微粒物中zui多只允許3個以下0.3微米的微粒物通過，即捕捉率高達99.995%。任何微粒物 如果它在空氣中，HEPA過濾網將會一視同仁的捕捉它，這些包括家庭灰塵、纖維、香煙煙霧、動物毛發、植物花粉、細菌、微菌及其他病毒、菌體。
細菌和病毒無法生存于沒有水份的環境下，大部分玄浮于空氣中的污染微粒物含有少量的水份這將提供細菌和病毒所賴以維生的物質。一旦玄浮微粒物與細菌、病毒同 被HEPA濾心所捕獲，HEPA細密的纖維會將之緊緊包覆，其水份很快地被蒸發，水份供應中斷，被捕獲的細菌、病毒便無法存活。
生物安全柜的HEPA過濾網可用于對空氣品質要求嚴格的場所，提供清凈的工作環境。這些場所如制造、光纖生產、化學分析、組織培養、醫藥生產、DNA、癌癥和其他生物研究、 病人隔離、底片制造及加工過程、磁碟制造、原子研究、外科手術。另HEPA空氣清凈機對空氣中過敏原微粒物之高濾凈效能，被證實能有效降低過敏及氣喘發病率。
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